本科生6000元/學(xué)年，長(zhǎng)學(xué)制學(xué)生本科階段按本科生標(biāo)準(zhǔn)收取，進(jìn)入二級(jí)學(xué)科階段按照當(dāng)年同類研究生學(xué)費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)收取；
住宿費(fèi)1200元/學(xué)年。

北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部的前身是國(guó)立北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校，創(chuàng)建于1912年10月26日，是中國(guó)政府依靠自己的力量開(kāi)辦的第一所專門(mén)傳授西方醫(yī)學(xué)的國(guó)立醫(yī)學(xué)校。
1903年，清朝政府在京師大學(xué)堂設(shè)立醫(yī)學(xué)實(shí)業(yè)館，1904年，醫(yī)學(xué)實(shí)業(yè)館改稱醫(yī)學(xué)館，遷入北京和門(mén)外八角琉璃井由興勝寺廟宇改建的館舍，1907年停辦。1910年，此館舍被施醫(yī)總局（當(dāng)時(shí)的衛(wèi)生部門(mén)）買去，為日后創(chuàng)立國(guó)立北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校提供了條件。

1911年，辛亥革命推翻了清王朝，建立了中華民國(guó)，在當(dāng)時(shí)的中國(guó)知識(shí)分子向西方學(xué)習(xí)的風(fēng)潮下，西醫(yī)在中國(guó)的地位，有了明顯的變化。一批從海外留學(xué)回來(lái)的醫(yī)學(xué)教育家立志通過(guò)發(fā)展醫(yī)學(xué)事業(yè)，增強(qiáng)人民的體質(zhì)，以洗刷長(zhǎng)期壓在中國(guó)人頭上的“東亞病夫”的恥辱。1912年9月，中華民國(guó)教育部電召?gòu)娜毡玖魧W(xué)歸來(lái)正在籌建浙江省立醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校的杭州人湯爾和到京，籌劃創(chuàng)立醫(yī)學(xué)校事宜。教育部以價(jià)銀10，000兩購(gòu)買了已經(jīng)停辦的醫(yī)學(xué)館館舍，劃撥給國(guó)立北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校使用，10月16日，中華民國(guó)教育部任命組織學(xué)教授湯爾和先生為北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校校長(zhǎng)，并于10月26日頒發(fā)校章。至此，中國(guó)第一所國(guó)立西醫(yī)學(xué)校正式誕生。當(dāng)時(shí)教職工9人，首批學(xué)生72人。湯爾和在開(kāi)學(xué)典禮上以“促進(jìn)社會(huì)文化，促進(jìn)文明，減少人們痛苦，用學(xué)術(shù)來(lái)和列強(qiáng)競(jìng)爭(zhēng)”，定位學(xué)校之辦學(xué)目的。湯爾和在建校后當(dāng)年，根據(jù)醫(yī)學(xué)教育的需要，結(jié)合中國(guó)國(guó)情制定了中國(guó)的《解剖條例》，多次呈文教育部請(qǐng)求公布，于1913年11月獲準(zhǔn)公布，這是中國(guó)第一個(gè)解剖法令，是北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校對(duì)中國(guó)醫(yī)學(xué)教育的一大貢獻(xiàn)，使中國(guó)的醫(yī)學(xué)發(fā)展真正建立在科學(xué)的基礎(chǔ)上。1915年2月，學(xué)校診察所正式開(kāi)業(yè)。1923年9月，國(guó)立北京醫(yī)學(xué)專門(mén)學(xué)校奉命改建為國(guó)立北京醫(yī)科大學(xué)校，并首次將醫(yī)學(xué)生學(xué)制設(shè)為六年制。1927年北京醫(yī)科大學(xué)校與北京所有國(guó)立高等學(xué)校被改組，合并成立國(guó)立京師大學(xué)校，成為京師大學(xué)校的一個(gè)科，更名為國(guó)立京師大學(xué)校醫(yī)科。同年，學(xué)校附設(shè)的診察所擴(kuò)充為學(xué)校附屬醫(yī)院。1928年11月，京師大學(xué)校改組為國(guó)立北大學(xué)，醫(yī)科改為醫(yī)學(xué)院，成為北大學(xué)醫(yī)學(xué)院。1929年，根據(jù)北大學(xué)的《組織規(guī)程》，規(guī)定醫(yī)學(xué)院以研究高深學(xué)術(shù)，培養(yǎng)醫(yī)學(xué)專門(mén)人才為宗旨。1931年，建立我國(guó)醫(yī)學(xué)校中第一個(gè)法醫(yī)教研室。1937年抗日戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)后，國(guó)立北大學(xué)西遷，部分醫(yī)學(xué)院師生一同西遷。留在北京的醫(yī)學(xué)院院務(wù)完全停頓，1938年1月，當(dāng)時(shí)的教育部將原北京大學(xué)和北大學(xué)合并辦起“國(guó)立北京大學(xué)”，醫(yī)學(xué)院為下設(shè)的六個(gè)學(xué)院之一。5月復(fù)課，并接收燕京大學(xué)和協(xié)和醫(yī)學(xué)院師生繼續(xù)學(xué)院的教學(xué)。1945年12月北京各公立大學(xué)被統(tǒng)一編為“北臨時(shí)大學(xué)補(bǔ)班”，北大學(xué)醫(yī)學(xué)院被編為“臨時(shí)大學(xué)補(bǔ)班第六分班”。1946年7月，北京大學(xué)在北復(fù)校。北臨時(shí)大學(xué)補(bǔ)班第六分班連同附屬醫(yī)院一同并入北京大學(xué)，成為北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院。院長(zhǎng)先后為解剖學(xué)教授馬文昭先生、生理學(xué)教授沈鈞淇先生和皮膚科學(xué)教授胡傳揆先生。胡傳揆教授同時(shí)任醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院（亦稱北大醫(yī)院）院長(zhǎng)。從此，學(xué)校作為北京大學(xué)的一部分，開(kāi)始了新的歷程。

1952年，全國(guó)高等學(xué)校院系調(diào)整，北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院脫離北京大學(xué)，獨(dú)立建院并更名為北京醫(yī)學(xué)院，院長(zhǎng)為胡傳揆教授。直屬中央衛(wèi)生部領(lǐng)導(dǎo)，辦學(xué)經(jīng)費(fèi)由中央財(cái)政部轉(zhuǎn)中央衛(wèi)生部撥付。北醫(yī)校址遷至今日的北京市海淀區(qū)學(xué)院路38號(hào)，由此，醫(yī)學(xué)院開(kāi)始了較大的發(fā)展。
1959年北醫(yī)被國(guó)家確定為全國(guó)十六所重點(diǎn)院校之一。1984經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，在全國(guó)重點(diǎn)建設(shè)10所大學(xué)，北京醫(yī)學(xué)院是唯一所醫(yī)科學(xué)校，院長(zhǎng)為醫(yī)學(xué)教育專家馬旭研究員。
1985年學(xué)校更名為北京醫(yī)科大學(xué)，運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)專家曲綿域教授任校長(zhǎng)。
進(jìn)入20世紀(jì)90年代中期，中國(guó)政府確立了教育發(fā)展改革綱要，明確提出“211工程”，即重點(diǎn)建設(shè)若干所大學(xué)，使之接或達(dá)到或超過(guò)世界一流水。1996年8月28日，北京醫(yī)科大學(xué)正式通過(guò)了國(guó)家首批“211工程”建設(shè)項(xiàng)目的論證，再次成為中國(guó)政府重點(diǎn)支持的醫(yī)科大學(xué)。從1991年至2000年4月，校長(zhǎng)為血液病學(xué)專家王德炳教授。2000年4月3日，北京醫(yī)科大學(xué)與北京大學(xué)正式合并，組建新的北京大學(xué)。2000年5月4日，北京醫(yī)科大學(xué)正式更名為北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部，中國(guó)科學(xué)院院士、病理生理專家韓啟德教授出任北京大學(xué)常務(wù)副校長(zhǎng)并兼任醫(yī)學(xué)部的主任。2003年，腫瘤分子生物學(xué)專家柯楊教授任北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部常務(wù)副主任至今。