首都醫(yī)科大學(xué)建校于1960年，是北京市重點高等院校，已故著名泌尿外科專家、兩院院士、全國人大常委會副委員長吳階教授為首任校長。現(xiàn)任黨委書記李明教授，校長呂兆豐教授。

學(xué)校校本部設(shè)有10所學(xué)院和1所研究院，包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、化學(xué)生物學(xué)與藥學(xué)院、生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院、中醫(yī)藥學(xué)院、衛(wèi)生管理與教育學(xué)院、護理學(xué)院、燕京醫(yī)學(xué)院、全科醫(yī)學(xué)與繼續(xù)教育學(xué)院、國際學(xué)院；北京腦重大疾病研究院。學(xué)校現(xiàn)有18所臨床醫(yī)學(xué)院暨附屬醫(yī)院，包括首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院（第一臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京友誼醫(yī)院（第二臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京朝陽醫(yī)院（第三臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京同仁醫(yī)院（第四臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京天壇醫(yī)院（第五臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京安貞醫(yī)院（第六臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬復(fù)興醫(yī)院（第八臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京佑安醫(yī)院（第九臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京胸科醫(yī)院（第十臨床醫(yī)學(xué)院）、北京三博腦科醫(yī)院（第十一臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京地壇醫(yī)院（第十二臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京兒童醫(yī)院（兒科醫(yī)學(xué)院）、附屬北京口腔醫(yī)院（口腔醫(yī)學(xué)院）、附屬北京安定醫(yī)院（精神衛(wèi)生學(xué)院）、附屬北京婦產(chǎn)醫(yī)院（婦產(chǎn)醫(yī)學(xué)院）、附屬北京中醫(yī)醫(yī)院（中醫(yī)藥臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京世紀壇醫(yī)院（腫瘤醫(yī)學(xué)院）和中國康復(fù)研究中心（康復(fù)醫(yī)學(xué)院），以及預(yù)防醫(yī)學(xué)教學(xué)基地（北京市疾病預(yù)防控制中心）。學(xué)校還設(shè)有10所教學(xué)醫(yī)院和35個臨床專科學(xué)院、專科學(xué)系。

學(xué)校學(xué)科力量雄厚。現(xiàn)有8個國家重點學(xué)科，2個國家重點（培育）學(xué)科，32個國家臨床重點專科，14個國家中醫(yī)藥管理局重點（培育）學(xué)科，4個北京市一級重點學(xué)科，6個北京市二級重點學(xué)科，1個北京市重點交叉學(xué)科，2個北京市一級重點建設(shè)學(xué)科，6個北京市二級重點建設(shè)學(xué)科，1個北京地區(qū)高等學(xué)校學(xué)科群。1個省部共建國家重點實驗室，3個教育部重點實驗室，1個教育部省部共建重點實驗室，24個北京市重點實驗室。有8個一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點和11個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點；按照三級學(xué)科統(tǒng)計，有59個博士學(xué)位授權(quán)點和78個碩士學(xué)位授權(quán)點。有9個博士后科研流動站。

學(xué)校本專科專業(yè)齊全，設(shè)置的七年制專業(yè)中有臨床醫(yī)學(xué)（包括兒科方向）和口腔醫(yī)學(xué)；本科專業(yè)中有臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、護理學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、假肢矯形工程、康復(fù)治療學(xué)、公共事業(yè)管理（衛(wèi)生管理）、醫(yī)學(xué)實驗技術(shù)、法學(xué)（衛(wèi)生法學(xué)）、臨床藥學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗技術(shù)等16個專業(yè)。高職高專教育設(shè)有護理、醫(yī)學(xué)檢驗技術(shù)、藥學(xué)等14個專業(yè)。現(xiàn)有全日制在校生9770人，其中研究生2741人，長學(xué)制學(xué)生1534人，本科生3009人，高專高職生2077人，留學(xué)生409人；成教學(xué)生4551人。學(xué)校培養(yǎng)醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科的學(xué)術(shù)型和應(yīng)用型人才，形成了全方位、多層次、創(chuàng)新型人才培養(yǎng)模式。
學(xué)校目前有7個國家級專業(yè)和10個北京市級專業(yè)，7門國家級精品課程和18門市級精品課程，2個國家級實驗教學(xué)示范中心和5個市級實驗教學(xué)示范中心，3個國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)和1個市級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)，3個北京市級校外人才培養(yǎng)基地和1個素質(zhì)培養(yǎng)基地，7個國家級優(yōu)秀教學(xué)團隊和11個市級優(yōu)秀教學(xué)團隊，1名國家級教學(xué)名師和14名市級教學(xué)名師。通過教育教學(xué)改革實踐，五年學(xué)校獲得教育教學(xué)成果國家特等獎1項、二等獎2項；北京市特等獎2項、一等獎10項、二等獎20項。
學(xué)校具有較強的學(xué)術(shù)發(fā)展與科研實力，在校本部和附屬醫(yī)院擁有一批國家級和市級重點學(xué)科和重點實驗室的基礎(chǔ)上，建有高水的國家級、市級研究和培訓(xùn)機構(gòu)，如國家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地、衛(wèi)生部全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心、北京市全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心、首都衛(wèi)生管理與政策研究基地等。學(xué)校有1個國家工程技術(shù)研究中心，1個教育部工程研究中心，6個北京市工程技術(shù)研究中心。5年來，學(xué)校承擔(dān)了國家“973”、“863”、國家自然科學(xué)基金、國家社會科學(xué)基金、北京市自然基金，以及教育部、衛(wèi)生部、科技部、北京市科委、北京市教委等科研項目2095項（其中國家級科研項目986項），累計科研經(jīng)費14.5億元；獲得各類各級獎勵86項，其中國家最高科技獎1項，國家科技進步獎7項、北京市科技獎29項、教育部“高等學(xué)校科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎（科學(xué)技術(shù)）20項、中華醫(yī)學(xué)科技獎23項、何梁何利科學(xué)與技術(shù)進步獎1項、吳階醫(yī)學(xué)獎3項、北京市哲學(xué)社會科學(xué)優(yōu)秀成果獎2項；獲得專利授權(quán)225項。神經(jīng)生物學(xué)、細胞生物學(xué)、基礎(chǔ)免疫學(xué)、醫(yī)學(xué)圖像處理、生物信息檢測與處理、神經(jīng)內(nèi)科、神經(jīng)外科、心臟內(nèi)外科、腎移植、呼吸內(nèi)科、消化內(nèi)科、口腔生物醫(yī)學(xué)、眼科、耳鼻咽喉科、小兒血液病等在國內(nèi)外享有較高的聲譽。
學(xué)校和附屬醫(yī)院現(xiàn)有教職員工和醫(yī)務(wù)人員33870人（校本部1567人，附屬醫(yī)院32303人）。有院士3人，特聘顧問11人，正高職稱1669人，副高職稱2988人。其中教授617人（校本部91人，附屬醫(yī)院526人）,副教授1108人（校本部193人，附屬醫(yī)院915人）；博士生導(dǎo)師360人（校本部78人，附屬醫(yī)院282人），碩士生導(dǎo)師742人（校本部111人，附屬醫(yī)院631人）。校本部和附屬醫(yī)院總占地面積136.1萬方米（校本部24.7萬方米,附屬醫(yī)院111.4萬方米）；總建筑面積216.5萬方米（校本部33.9萬方米，附屬醫(yī)院182.6萬方米）；固定資產(chǎn)總值159.1億元（校本部14.9億元，附屬醫(yī)院144.2億元）；教學(xué)科研儀器設(shè)備總值23.6億元（校本部10.0億元，附屬醫(yī)院13.6億元）；圖書館藏書128.0萬冊（校本部79.7萬冊，附屬醫(yī)院48.3萬冊）；住院病床17035張。
學(xué)校有良好的教學(xué)科研輔助設(shè)施，建有圖書館、檔案館、醫(yī)學(xué)實驗與測試中心、信息與通訊中心、現(xiàn)代教育技術(shù)中心、臨床檢測中心、實驗動物部、學(xué)報編輯部、校史館、中醫(yī)研修學(xué)院及首都國醫(yī)名師館、生命與健康博物館（籌）、后勤服務(wù)集團、校醫(yī)院等健全的技術(shù)服務(wù)臺。
學(xué)校十分重視國際、國內(nèi)交流與合作，先后與美國、加拿大、澳大利亞、英國、瑞典、挪威、香港、臺灣等30多個國家和地區(qū)的高校和相關(guān)單位簽訂了友好交流合作協(xié)議。先后接待50多個國家和地區(qū)的專家學(xué)者和學(xué)生數(shù)百人來校進行學(xué)術(shù)交流和參觀訪問。目前，我校聘請的外籍專家共18人，聘請的外國及港澳臺地區(qū)客座教授59人；在校學(xué)歷教育海外學(xué)生438名，覆蓋46個國家和地區(qū)。學(xué)校海外學(xué)生涵蓋了本科、碩士、博士研究生及進修生。同時，學(xué)校積極選送教師、科研人員和管理干部出國進修，參加學(xué)術(shù)會議和考察訪問。
建校50年來，學(xué)校形成了“扶傷濟世、敬德修業(yè)”的校訓(xùn)、“愛國奉獻、艱苦奮斗、救死扶傷、嚴謹求實”的校風(fēng)和“勤學(xué)、博思、求精、創(chuàng)新”的學(xué)風(fēng)，并形成了比較完整的學(xué)校文化標識系統(tǒng)。同時，不斷以首醫(yī)人的奮斗歷程豐富著“首醫(yī)精神”的文化寶庫，激勵著首醫(yī)人繼續(xù)團結(jié)奮進。
校黨委始終把加強黨的先進性建設(shè)、推動事業(yè)科學(xué)發(fā)展作為學(xué)校黨建和政治工作的根本出發(fā)點和落腳點，“在沖鋒中建先鋒”的黨建理念深入人心。學(xué)校堅持育人為本、德育為先，不斷加強學(xué)生德育和教育管理工作。2007年，學(xué)校獲評北京市黨建和政治工作先進高校。
全體首醫(yī)人求真務(wù)實、齊心協(xié)力、自主創(chuàng)新、和諧發(fā)展，正在努力將首都醫(yī)科大學(xué)建設(shè)成為立足首都、面向全國、走向世界，國內(nèi)一流、國際知名的醫(yī)科大學(xué)。