部級重點研究基地8個，國家級實驗教學示范中心1個，省級重點實驗室3個，省級實踐教學示范中心５個，省級產學研合作示范基地3個。吉首大學學報（社會科學版）為“全國中文核心期刊”、“全國百強社科學報”，吉首大學學報（自然科學版）為“全國高校科技期刊”。學校還是湖南省唯一的“省屬高校少數民族預科教育基地”。

學校面向全國28個省（市）、自治區招生。現有各類在籍學生3.2萬余人，其中全日制本專科生17000余人，碩士研究生600余人，招有韓國、美國等國留學生及交換生。此外，吉首大學張家界學院（三本獨立學院）招有本科生7000余人。

辦學50多年來，學校共培養各類高級專門人才90000余名。學校以“人文精神、科學素養、創新能力、務實作風”為培養目標，5年來，學生參加各類競賽共獲國家級獎項70余項，省部級獎項120余項。學校的畢業生秉承“以人名校、以業報國”的校訓，踐行“鳳飛千仞，薪傳八方”的辦學精神，以“下得去、留得注用得上、干得好”的過硬作風，深為社會和用人單位所歡迎，廣大畢業生在祖國各地勤奮工作、建功立業，許多人現已成長為各級領導和各行各業的骨干力量。年來，學校的畢業生就業率均保持在93％以上。

5年來，學校承擔各級各類科研課題860余項，其中國家自然科學基金課題20余項、國家社會科學基金課題80余項，并獲國家教學成果二等獎2項，省級教學成果獎30余項，省部級科技成果獎50余項。學校在科研成果轉化方面，取得了顯著的經濟和社會效益。具有自主知識產權的美味獼猴桃“米良1號”被國務院扶貧辦列為扶貧開發項目，在全國16個省（市）推廣栽種，僅湘西自治州種植面積就達10萬余畝。從獼猴桃中提取的“果王素”經國內專家鑒定“達到國內領先水，填補國際空白”，獼猴桃研究成果的產業化幫助湘西20萬農民擺脫貧困。湘西礦產資源和植物資源的研究成果已經孵化出10家高新技術企業。湘西民族歷史文化研究帶動了湘西社會發展，推動了湘西旅游產業的蓬勃興起。區域經濟及開發模式研究多項成果被各級政府和企業采納。
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