祖姓出自子姓，起源于商朝。黃帝的后裔。始祖為祖已。祖姓在宋版《百家姓》中排序為第二百四十九位。名人輩出，有祖逖、祖沖之等。

第一個淵源：源于子姓，出自商王朝王族之后裔，屬于以先祖名字為氏。

商王朝的開國君王叫“湯”，所以后史中提到商王朝的時候也多稱商湯。

湯的六代孫開始有祖乙、祖辛、祖丁、祖庚、祖甲、祖己……都曾是商王朝君王的廟號，其中的祖乙，名字叫子滕，是這些商王中最有作為的帝王，他任用巫賢為相，勵精圖治，使當時已經衰落下去的商王朝中興起來。

關于祖已的世系，一般認為是：

少典→軒轅→玄囂→?極→?[夔]→契[?]→昭明[王吳]→相土[土]→昌若[羔]→曹圉[根圉]→冥[季]→核[王亥]→微[上甲]→報丁[報乙]→報乙[報丙]→報丙[報丁]→主壬[示壬]→主癸[示癸]→履（天乙、成湯）[太乙、唐、成]→[太丁]→至[太甲]→辨[太庚]→密[太戊]→整（河?甲）[戔甲]→滕[祖乙]→旦[祖辛]→新[祖丁]→斂[小乙]→昭[武丁]→曜[祖庚]→載[祖甲]→孝己[祖己（祖伊）]。

商王之名出自史籍《竹書紀年》中的記載，“[]”內的名號是甲古文字記載的君王廟號。

在商王朝開國君主商湯執政時期，有一個著名的左相仲虺，在仲虺的后代中，有人名叫祖己（祖伊），為仲虺之后的商王朝宰相。

據史籍《元和姓纂》和《姓譜》等書記載：“子姓，殷后，殷王祖甲、乙、丙、丁支庶因氏焉，殷有祖己、祖伊，漢有祖沂，始家涿郡，望出范陽�！�

姓氏學界一般認為，祖氏得姓始祖應當從祖已起算。在殷商武丁的時間，從古籍上已經發現了最早姓祖者的史實記載，那便是當時以“道訓諫王”的賢臣祖已，這在典籍《書經?高宗彤日》中有明確記載：“高宗祭成湯，有飛雉升鼎耳而雒；祖已訓諸王，作高宗彤日之訓。”

商高宗，就是武丁子昭（公元前1250～前1192年在位），祖己時為商王朝的國相，他借用商高宗在祭祀成湯的重大典禮上，獻祭品野雉飛到了國鼎之上的現象，引道訓諫商高宗及其王子們要“仁政治國”。

按此記載，祖氏家族的得姓歷史至少在三千三百年以上。

在祖己（祖伊）的后裔子孫中，有取先祖名字為姓氏者，稱祖氏，世代相傳至今，祖氏最初是發祥于涿郡，是非常古早的姓氏之一。

第二個淵源：源于蒙古族，屬于漢化改姓為氏。

蒙古族各根義召日氏，是一個十分特殊的姓氏群體，就是世代的“守陵者”。

蒙語“各各召”是“祖墳”之意，延伸的“各根義召日”表明為更崇高的“祖陵”，多用于對蒙古民族歷史商功勛卓著的先祖、王爺、可汗、大汗等陵寢的尊稱，后有專職世襲的守陵人取之為家族姓氏，即稱各根義召日氏。

在明朝時期，有蒙古族各根義召日氏族人取姓氏的漢義改冠漢姓為祖氏者，世代相傳至今。

第三個淵源：源于滿族，屬于漢化改姓為氏。

據史籍《清朝通志?氏族略?滿洲八旗姓》記載：

⑴.滿族薩克達氏，本稱巴雅拉氏，后改以地名為氏，滿語為Sakda Hala，滿語“蒼老、老祖宗”，是一個龐大的滿族氏族部落，有諸多分支，世居寧古塔（今黑龍江寧安）、阿扈河（今黑龍江寧安南部六十公里處）、葉赫（今吉林葉赫河、伊通河、伊丹河、東遼河流域）、薩克達（今遼寧撫順峽河流域）、赫圖阿拉（今遼寧新賓永陵鎮）、那木都魯（今俄羅斯濱海地區）、德里倭赫（今遼寧撫順渾河兩岸）、黑龍江兩岸等地，所冠漢姓為多為祖氏、蒼氏、倉氏、麻氏、駱氏、李氏、高氏、海氏、薩氏、里氏、陳氏、羅氏、老氏、英氏、印氏、巴氏、色氏、臧氏、禮氏、佟氏、陀氏、翁氏等。

⑵.滿族組佳氏，滿語為Jugiya Hala，祖先原為漢族，東漢末期被遼東鮮卑烏桓部虜攜，融入鮮卑，后逐漸演化為遼東女真，世居鐵嶺（今遼寧鐵嶺），后多冠漢姓為祖氏。

第四個淵源：源于其他少數民族，屬于漢化改姓為氏。

今彝族、東鄉族、傣族、苗族等少數民族中，均有祖氏族人分布，其來源大多是在唐、宋、元、明、清時期中央政府推行的羈糜政策及改土歸流運動中，流改為漢姓□氏，世代相傳至今。

祖氏是河北省的名門著姓，他們是殷商王室的子孫后裔，就是受千秋萬世敬仰的上古圣君商湯的子孫。祖氏的來源，《元和姓纂》和《姓譜》等書記載說：“子姓，殷后，殷王祖甲、乙、丙、丁支庶因氏焉，殷有祖己、祖伊，漢有祖沂，始家涿郡，望出范陽�！痹谝笊逃刑煜碌�645年之中，前后28個君主，以祖為名的君主不在少數，有第十一代的祖乙、第十二代的祖辛、第十四代的祖丁、第二十一代的祖庚等等。后世祖姓中國人的始祖，究竟是哪一位呢？一般人認為應該算是祖已，因為在殷商武丁的時間，從古籍上已經發現了了姓祖的人，那便是當時以道訓諫王的賢臣祖已�！稌�經》上的“高宗彤日”指出：“高宗祭成湯，有飛雉升鼎耳而雒；祖已訓諸王，作高宗彤日之訓。”根據這個記載，中國祖氏家族的得姓歷史至少在3300年以上。由此可見，祖氏是中國一個古老的姓氏，最初是發祥于涿郡。古代的涿郡，在今河北省涿縣一帶，這個地方便是祖氏的老家所在，他跟中華民族的淵源十分深遠。5000年前，黃帝與尤戰于涿鹿之野，奠定中華民族繁衍成長的地盤，就是這個地方。望族居范陽郡（今河北涿縣）。故祖氏后人多奉祖已為祖姓的始祖。今山東省的壽光縣、夏津縣，北京市的海淀區，湖北省的英山縣，上海市，天津市，河北省的藁城市、樂亭縣、福寧縣、獻縣、深縣、新樂縣、撫寧縣、定興縣、衡水市、易縣、秦皇島市、保定市、高碑店市、涿州市、淶水縣，江蘇省的南京市、蘇州市楓橋支英村，徐州市銅山縣、淮安市、盱眙縣侍澗村、宿遷市泗洪縣、南通市海門縣、昆山市、阜寧縣，河南省的濮陽市范縣、南陽市南召縣、開封市、商丘市柘城縣、衛輝縣、固始縣、新鄉市，安徽省的池州市、安慶市、馬鞍山市 望江縣、蕭縣、樅陽縣、巢湖市廬江縣（不僅僅是廬江縣，本人姓祖，是居巢區的）、蚌埠市、滁州市、宿州市，四川省的廣元縣，吉林省的吉林市永吉縣、四市、通化市白山市的撫松縣，寧夏回族自治區，重慶市的長壽縣，湖南省的瀏陽市，福建省的德化縣、浦城縣、順昌縣，貴州省的貴陽市、威寧縣、畢節市，廣東省的東莞市東城區，甘肅省的張掖市，遼寧省的沈陽市、盤錦市興隆臺區、北鎮縣，新疆維吾爾自治區農六師紅旗農場、香港特別行政區，澳門特別行政區，臺灣省，新加坡、泰國、馬來西亞、印度尼西亞、越南、老撾、緬甸、美國、英國等地，均有祖氏族人分布。