學(xué)校始建于1951年，前身為西南區(qū)川南醫(yī)士學(xué)校，1959年升格并更名為瀘州醫(yī)學(xué)專科學(xué)校，1978年升格并更名為瀘州醫(yī)學(xué)院，1993年成為碩士學(xué)位授權(quán)單位，2001年開始聯(lián)合培養(yǎng)博士，2003年開始留學(xué)生學(xué)歷教育。更名為西南醫(yī)科大學(xué)。

學(xué)校占地2011畝。在校本科生、研究生、留學(xué)生17005人。學(xué)校有專任教師1056人，其中博士241人;具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)的專任教師495人，其中正教授135人；碩士生導(dǎo)師616人，博士生導(dǎo)師17人。有教育部“*”講座教授、國家“百千萬人才工程”第一、二層次人選、享受國務(wù)院政府特殊津貼專家等高層次人才356人次。

學(xué)校有碩士學(xué)位一級(jí)學(xué)科授權(quán)點(diǎn)7個(gè)，專業(yè)學(xué)位7個(gè)，省部級(jí)重點(diǎn)學(xué)科7個(gè)。有26個(gè)普通本科專業(yè)，其中國家專業(yè)3個(gè)，本科第一批次招生專業(yè)13個(gè)，雙學(xué)位專業(yè)5個(gè)。學(xué)校是國家第一批“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目”（2項(xiàng)）、“臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)綜合改革”、“臨床醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位研究生培養(yǎng)模式改革”試點(diǎn)高校。有省級(jí)精品課程及精品資源共享課程26門，省級(jí)人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)2個(gè)、省級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心4個(gè)、省級(jí)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心2個(gè)。是四川省卓越法律人才教育培養(yǎng)計(jì)劃示范性實(shí)踐教學(xué)基地。兩屆獲四川省高等教育教學(xué)成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)3項(xiàng)。據(jù)國家考試中心數(shù)據(jù)顯示，我校醫(yī)學(xué)學(xué)科專業(yè)畢業(yè)生執(zhí)業(yè)資格考試通過率在全國高等院校中名列前茅。

學(xué)校有教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國家級(jí)博士后科研工作站、國家藥物臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)、省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、省科技基礎(chǔ)條件臺(tái)等研究基地和機(jī)構(gòu)，是“四川2011心血管疾病防治協(xié)同創(chuàng)新中心”牽頭單位，有以醫(yī)藥、醫(yī)療器械研發(fā)為的省級(jí)大學(xué)科技園。五年，獲省部級(jí)科技成果獎(jiǎng)24項(xiàng)，其中省政府一等獎(jiǎng)3項(xiàng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、三等獎(jiǎng)2項(xiàng)，獲得授權(quán)專利53項(xiàng)。

年來，學(xué)校不斷加強(qiáng)對(duì)外交流與合作，先后與美國、英國、加拿大、港澳臺(tái)等23個(gè)國家和地區(qū)的高校、醫(yī)療衛(wèi)生和科研機(jī)構(gòu)建立了合作交流關(guān)系，積極開展聯(lián)合培養(yǎng)博士、互訪、教師培訓(xùn)、學(xué)生交流和科研合作。先后邀請(qǐng)了美國國立健康研究院、英國斯旺西大學(xué)等國外大學(xué)及科研機(jī)構(gòu)的專家學(xué)者來校交流訪問。先后舉辦了“中國酒城國際心血管研究高端論壇”、“第五屆國際離子通道學(xué)術(shù)大會(huì)”、“腫瘤醫(yī)學(xué)高端研討會(huì)”等國際學(xué)術(shù)會(huì)議。

學(xué)校是四川省高等學(xué)校教育信息化示范學(xué)校。圖書館是四川省自動(dòng)化、網(wǎng)絡(luò)化建設(shè)優(yōu)秀圖書館。

學(xué)校有三級(jí)甲等直屬附屬醫(yī)院3所，有部省級(jí)醫(yī)學(xué)學(xué)科17個(gè)，是國家全科醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地、國家或省級(jí)住院醫(yī)生和專科醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地，是擁有4000多萬人口的川滇黔渝結(jié)合區(qū)域的省級(jí)醫(yī)療衛(wèi)生中心。